Table of Contents - crb-blast-0.6.9 Documentation
Classes and Modules
- CRB_Blast
- CRB_Blast::Bio
- CRB_Blast::Bio::FastaFormat
- CRB_Blast::CRB_Blast
- CRB_Blast::Cmd
- CRB_Blast::Hit
- CRB_Blast::VERSION
Methods
- ::new — CRB_Blast::Cmd
- ::new — CRB_Blast::CRB_Blast
- ::new — CRB_Blast::Hit
- #clear_memory — CRB_Blast::CRB_Blast
- #find_reciprocals — CRB_Blast::CRB_Blast
- #find_secondaries — CRB_Blast::CRB_Blast
- #has_reciprocal? — CRB_Blast::CRB_Blast
- #isNucl? — CRB_Blast::Bio::FastaFormat
- #isProt? — CRB_Blast::Bio::FastaFormat
- #load_outputs — CRB_Blast::CRB_Blast
- #makedb — CRB_Blast::CRB_Blast
- #run — CRB_Blast::Cmd
- #run — CRB_Blast::CRB_Blast
- #run_blast — CRB_Blast::CRB_Blast
- #run_blast_with_splitting — CRB_Blast::CRB_Blast
- #run_blast_with_threads — CRB_Blast::CRB_Blast
- #size — CRB_Blast::CRB_Blast
- #split_input — CRB_Blast::CRB_Blast
- #tidy_up — CRB_Blast::CRB_Blast
- #to_s — CRB_Blast::Hit
- #write_output — CRB_Blast::CRB_Blast