Table of Contents - publisci-0.1.6 Documentation
Pages
Classes and Modules
- BioPublisci
- Object
- PubliSci
- PubliSci::Analyzer
- PubliSci::CustomPredicate
- PubliSci::DSL
- PubliSci::DSL::Configuration
- PubliSci::DSL::Instance
- PubliSci::DataSet
- PubliSci::DataSet::ORM
- PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- PubliSci::DataSet::ORM::Observation
- PubliSci::Dataset
- PubliSci::Dataset::Configuration
- PubliSci::Dataset::DSL
- PubliSci::Dataset::DSL::Instance
- PubliSci::Dataset::DataCube
- PubliSci::Generators
- PubliSci::Generators::Base
- PubliSci::Generators::MAF
- PubliSci::Interactive
- PubliSci::Metadata
- PubliSci::Metadata::DSL
- PubliSci::Metadata::DSL::Instance
- PubliSci::Metadata::Generator
- PubliSci::Metadata::Model
- PubliSci::Metadata::Model::Meta
- PubliSci::Metadata::Publisher
- PubliSci::ORM
- PubliSci::ORM::Component
- PubliSci::ORM::DataSet
- PubliSci::ORM::DataStructureDefinition
- PubliSci::ORM::Dimension
- PubliSci::ORM::Measure
- PubliSci::ORM::Observation
- PubliSci::Parsers
- PubliSci::Parsers::Base
- PubliSci::Parsers::MAF
- PubliSci::PostProcessor
- PubliSci::Prov
- PubliSci::Prov::Activity
- PubliSci::Prov::Activity::Associations
- PubliSci::Prov::Activity::Generations
- PubliSci::Prov::Activity::Usages
- PubliSci::Prov::Agent
- PubliSci::Prov::Association
- PubliSci::Prov::Configuration
- PubliSci::Prov::DSL
- PubliSci::Prov::DSL::Instance
- PubliSci::Prov::Dereferencable
- PubliSci::Prov::Derivation
- PubliSci::Prov::Element
- PubliSci::Prov::Entity
- PubliSci::Prov::Entity::Derivations
- PubliSci::Prov::Model
- PubliSci::Prov::Model::Activity
- PubliSci::Prov::Model::Agent
- PubliSci::Prov::Model::Association
- PubliSci::Prov::Model::Derivation
- PubliSci::Prov::Model::Entity
- PubliSci::Prov::Model::Plan
- PubliSci::Prov::Plan
- PubliSci::Prov::Role
- PubliSci::Prov::Usage
- PubliSci::Query
- PubliSci::QueryHelper
- PubliSci::RDFParser
- PubliSci::Readers
- PubliSci::Readers::ARFF
- PubliSci::Readers::Base
- PubliSci::Readers::CSV
- PubliSci::Readers::Dataframe
- PubliSci::Readers::MAF
- PubliSci::Readers::Output
- PubliSci::Readers::RCross
- PubliSci::Readers::RMatrix
- PubliSci::Registry
- PubliSci::SADI_request
- PubliSci::Store
- PubliSci::Vocabulary
- PubliSci::Writers
- PubliSci::Writers::ARFF
- PubliSci::Writers::Base
- PubliSci::Writers::Builder
- PubliSci::Writers::CSV
- PubliSci::Writers::Dataframe
- RDF
- RDF::CC
- RDF::CERT
- RDF::DC
- RDF::DC11
- RDF::DOAP
- RDF::EXIF
- RDF::FOAF
- RDF::GEO
- RDF::HTTP
- RDF::MA
- RDF::OWL
- RDF::Query
- RDF::Query::Solutions
- RDF::RDFS
- RDF::RSA
- RDF::RSS
- RDF::SIOC
- RDF::SIOC::Types
- RDF::SKOS
- RDF::WOT
- RDF::XHTML
- RDF::XSD
- String
Methods
- ::activities — PubliSci::Prov
- ::agents — PubliSci::Prov
- ::associations — PubliSci::Prov
- ::base_url — PubliSci::Prov
- ::base_url= — PubliSci::Prov
- ::column_replace — PubliSci::Generators::MAF
- ::configuration — PubliSci::Dataset
- ::configuration — PubliSci::Prov
- ::defaults — PubliSci::Dataset::Configuration
- ::defaults — PubliSci::DSL::Configuration
- ::defaults — PubliSci::Prov::Configuration
- ::download — PubliSci::Dataset
- ::entities — PubliSci::Prov
- ::fetch_async — PubliSci::SADI_request
- ::for — PubliSci::Dataset
- ::generate_n3 — PubliSci::Readers::MAF
- ::included — PubliSci::Prov::DSL
- ::load — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- ::new — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- ::new — PubliSci::DataSet::ORM::Observation
- ::new — PubliSci::Dataset::DSL::Instance
- ::new — PubliSci::Metadata::DSL::Instance
- ::new — PubliSci::Prov::DSL::Instance
- ::new — PubliSci::Store
- ::official_symbol — PubliSci::Generators::MAF
- ::parse_barcode — PubliSci::Generators::MAF
- ::plans — PubliSci::Prov
- ::poll — PubliSci::SADI_request
- ::post_process — PubliSci::Generators::MAF
- ::prefixes — PubliSci::Prov
- ::process — PubliSci::PostProcessor
- ::process_line — PubliSci::Generators::MAF
- ::process_options — PubliSci::Generators::MAF
- ::process_record — PubliSci::Parsers::MAF
- ::r_object — PubliSci::Dataset
- ::reader_registry — PubliSci::Dataset
- ::register_reader — PubliSci::Dataset
- ::reset_settings — PubliSci::Prov
- ::run — PubliSci::Prov
- ::send_request — PubliSci::SADI_request
- ::sio_values — PubliSci::Generators::MAF
- ::structure — PubliSci::Generators::MAF
- ::symbol_for — PubliSci::Prov
- ::try_fetch — PubliSci::SADI_request
- ::valid? — PubliSci::Parsers::MAF
- ::write — PubliSci::Generators::MAF
- ::write_structure — PubliSci::Generators::MAF
- #[] — PubliSci::Prov::Dereferencable
- #__label — PubliSci::Prov::Association
- #__label — PubliSci::Prov::Derivation
- #__label — PubliSci::Prov::Usage
- #__label — PubliSci::Prov::Element
- #__label= — PubliSci::Prov::Element
- #abbreviate_known — PubliSci::Dataset::DataCube
- #abbreviate_known — PubliSci::Prov::DSL
- #activities — PubliSci::Prov::Model::Agent
- #activity — PubliSci::Prov::Derivation
- #activity — PubliSci::Prov::Model::Association
- #activity — PubliSci::Prov::DSL
- #activity — PubliSci::Metadata::Generator
- #add — PubliSci::Store
- #add_all — PubliSci::Store
- #add_custom — PubliSci::CustomPredicate
- #add_dimension — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #add_measure — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #add_node — PubliSci::RDFParser
- #add_observation — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #add_or_get — PubliSci::Dataset::DSL
- #add_or_get — PubliSci::Metadata::DSL
- #add_publisher — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #add_subject — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #agent — PubliSci::Prov::Association
- #agent — PubliSci::Prov::DSL
- #all_types — PubliSci::Prov::Model::Entity
- #associated_with — PubliSci::Prov::Activity
- #author — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #author= — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #automatic — PubliSci::Readers::CSV
- #automatic — PubliSci::Readers::Base
- #base_url — PubliSci::Prov::DSL
- #base_url= — PubliSci::DSL
- #basic — PubliSci::Metadata::Generator
- #basic_keyword — PubliSci::Prov::Element
- #basic_list — PubliSci::Prov::Element
- #block_list — PubliSci::Prov::Element
- #bnode_value — PubliSci::RDFParser
- #build_arff — PubliSci::Writers::ARFF
- #build_csv — PubliSci::Writers::CSV
- #check_integrity — PubliSci::Analyzer
- #close_output — PubliSci::Generators::Base
- #code_lists — PubliSci::Dataset::DataCube
- #codes — PubliSci::Readers::CSV
- #codes — PubliSci::Readers::Dataframe
- #codes — PubliSci::Readers::RCross
- #codes — PubliSci::Readers::RMatrix
- #codes — PubliSci::Writers::Base
- #comment — PubliSci::Prov::Role
- #component_gen — PubliSci::Dataset::DataCube
- #component_specifications — PubliSci::Dataset::DataCube
- #components — PubliSci::Readers::ARFF
- #concept_codes — PubliSci::Dataset::DataCube
- #configuration — PubliSci::DSL
- #configure — PubliSci::DSL
- #configure — PubliSci::Prov::DSL
- #create_dataframe — PubliSci::Writers::Dataframe
- #creator — PubliSci::Metadata::DSL
- #custom — PubliSci::CustomPredicate
- #data — PubliSci::Prov::Derivation
- #data — PubliSci::Readers::ARFF
- #data — PubliSci::DSL
- #data — PubliSci::Prov::DSL
- #dataSet — PubliSci::Writers::Base
- #data_structure_definition — PubliSci::Dataset::DataCube
- #dataset — PubliSci::Dataset::DataCube
- #dataset — PubliSci::Metadata::DSL
- #date — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #date — PubliSci::Metadata::DSL
- #date= — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #defaults — PubliSci::Store
- #defaults — PubliSci::Dataset::DataCube
- #defaults — PubliSci::Metadata::Generator
- #dereference — PubliSci::Prov::Dereferencable
- #description — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #description — PubliSci::Metadata::DSL
- #description= — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #dimension — PubliSci::Dataset::DSL
- #dimension_properties — PubliSci::Dataset::DataCube
- #dimensions — PubliSci::Readers::CSV
- #dimensions — PubliSci::Readers::Dataframe
- #dimensions — PubliSci::Readers::RCross
- #dimensions — PubliSci::Readers::RMatrix
- #dimensions — PubliSci::Writers::Base
- #dirty? — PubliSci::Analyzer
- #each — PubliSci::Parsers::Base
- #each_rec — PubliSci::Parsers::Base
- #each_record — PubliSci::Parsers::Base
- #encode_data — PubliSci::Dataset::DataCube
- #encode_value — PubliSci::RDFParser
- #entity — PubliSci::Prov::Derivation
- #entity — PubliSci::Prov::Usage
- #entity — PubliSci::Prov::DSL
- #enum_method — PubliSci::Parsers::MAF
- #enum_method — PubliSci::Parsers::Base
- #execute — PubliSci::Query
- #execute_from_file — PubliSci::Query
- #framestring — PubliSci::Writers::Dataframe
- #from_store — PubliSci::Writers::ARFF
- #from_store — PubliSci::Writers::CSV
- #from_store — PubliSci::Writers::Builder
- #from_turtle — PubliSci::Writers::ARFF
- #from_turtle — PubliSci::Writers::CSV
- #from_turtle — PubliSci::Writers::Builder
- #generate — PubliSci::Dataset::DataCube
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::ARFF
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::CSV
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::Dataframe
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::RCross
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::RMatrix
- #generate_n3 — PubliSci::DSL
- #generate_n3 — PubliSci::Dataset::DSL
- #generate_n3 — PubliSci::Metadata::DSL
- #generate_n3 — PubliSci::Prov::DSL
- #generate_n3 — PubliSci::Generators::Base
- #generate_n3 — PubliSci::Readers::Base
- #generate_resources — PubliSci::Dataset::DataCube
- #generate_subject — PubliSci::Prov::Element
- #generated — PubliSci::Prov::Activity
- #generated_by — PubliSci::Prov::Entity
- #get_ary — PubliSci::RDFParser
- #get_hashes — PubliSci::RDFParser
- #get_rownames — PubliSci::Writers::Dataframe
- #get_vectors — PubliSci::Writers::Dataframe
- #had_activity — PubliSci::Prov::Derivation
- #had_plan — PubliSci::Prov::Association
- #had_role — PubliSci::Prov::Association
- #had_role — PubliSci::Prov::Usage
- #handle_input — PubliSci::Writers::Base
- #has — PubliSci::CustomPredicate
- #has_data? — PubliSci::Prov::Model::Entity
- #input — PubliSci::Dataset::DSL
- #insert — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #interact — PubliSci::Interactive
- #is_complex? — PubliSci::RDFParser
- #is_uri? — PubliSci::RDFParser
- #label — PubliSci::Metadata::Publisher
- #labels_for — PubliSci::Readers::RCross
- #labels_for — PubliSci::Readers::RMatrix
- #load_folder — Object
- #load_properties — PubliSci::ORM::Observation
- #load_repo — PubliSci::ORM
- #load_string — PubliSci::RDFParser
- #map_ — PubliSci::Prov::Dereferencable
- #measure — PubliSci::Dataset::DSL
- #measure_properties — PubliSci::Dataset::DataCube
- #measures — PubliSci::Readers::CSV
- #measures — PubliSci::Readers::Dataframe
- #measures — PubliSci::Readers::RCross
- #measures — PubliSci::Readers::RMatrix
- #measures — PubliSci::Writers::Base
- #metadata — PubliSci::DSL
- #metadata_help — PubliSci::Metadata::Generator
- #method — PubliSci::Prov::Activity::Associations
- #method — PubliSci::Prov::Activity::Generations
- #method — PubliSci::Prov::Activity::Usages
- #method — PubliSci::Prov::Entity::Derivations
- #method — PubliSci::Prov::Dereferencable
- #name — PubliSci::Prov::Agent
- #name — PubliSci::Prov::Model::Agent
- #name — PubliSci::Metadata::Publisher
- #name — PubliSci::Metadata::DSL
- #name= — PubliSci::Prov::Agent
- #name= — PubliSci::Prov::Model::Agent
- #named_element — PubliSci::Prov::DSL
- #next_label — PubliSci::Readers::Base
- #num_individuals — PubliSci::Readers::RCross
- #object — PubliSci::Dataset::DSL
- #observation_data — PubliSci::Readers::CSV
- #observation_data — PubliSci::Readers::Dataframe
- #observation_data — PubliSci::Readers::RCross
- #observation_data — PubliSci::Readers::RMatrix
- #observation_hash — PubliSci::RDFParser
- #observation_labels — PubliSci::Readers::CSV
- #observation_labels — PubliSci::Readers::Dataframe
- #observations — PubliSci::Writers::Base
- #observations — PubliSci::Dataset::DataCube
- #on_behalf_of — PubliSci::Prov::Agent
- #option — PubliSci::Dataset::DSL
- #options — PubliSci::Dataset::DSL
- #org_metadata — PubliSci::Metadata::Generator
- #organization — PubliSci::Prov::Model::Entity
- #organization — PubliSci::Prov::DSL
- #output — PubliSci::Prov::DSL
- #output — PubliSci::Readers::Output
- #parse_options — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #plan — PubliSci::Prov::Association
- #plan — PubliSci::Prov::DSL
- #prefixes — PubliSci::Dataset::DataCube
- #process — PubliSci::Metadata::Generator
- #process_record — PubliSci::Parsers::Base
- #property_names — PubliSci::Query
- #property_values — PubliSci::Query
- #provenance — PubliSci::DSL
- #provenance — PubliSci::Metadata::Generator
- #publisher — PubliSci::Metadata::DSL
- #publishers — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #publishers — PubliSci::Metadata::DSL
- #publishers= — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #query — PubliSci::Store
- #r2rdf_metadata — PubliSci::Metadata::Generator
- #recommend_range — PubliSci::Analyzer
- #recommend_range_strings — PubliSci::Analyzer
- #register — PubliSci::Registry
- #registry — PubliSci::Registry
- #relation — PubliSci::Readers::ARFF
- #reload_observation — PubliSci::ORM
- #repo_to_ruby — PubliSci::Writers::Base
- #return_objects — PubliSci::Prov::DSL
- #role — PubliSci::Prov::Association
- #role — PubliSci::Prov::Usage
- #row_names — PubliSci::Query
- #rows — PubliSci::Readers::RMatrix
- #sanitize — PubliSci::RDFParser
- #sanitize_hash — PubliSci::RDFParser
- #save_workspace — PubliSci::Writers::Dataframe
- #set — PubliSci::CustomPredicate
- #set_or_get — PubliSci::Dataset::DSL
- #set_or_get — PubliSci::Metadata::DSL
- #settings — PubliSci::DSL
- #settings — PubliSci::Dataset::DSL
- #settings — PubliSci::Prov::DSL
- #sio_attribute — PubliSci::Readers::Base
- #sio_value — PubliSci::Readers::Base
- #source — PubliSci::Prov::Entity
- #source — PubliSci::Dataset::DSL
- #steps — PubliSci::Prov::Plan
- #strip_prefixes — PubliSci::RDFParser
- #strip_uri — PubliSci::ORM::Observation
- #strip_uri — PubliSci::ORM
- #strip_uri — PubliSci::RDFParser
- #structure — PubliSci::Readers::RCross
- #structure — PubliSci::Readers::RMatrix
- #subject — PubliSci::Prov::Derivation
- #subject — PubliSci::Prov::Element
- #subject= — PubliSci::Prov::Element
- #subject_id — PubliSci::Prov::Element
- #subjects — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #subjects= — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #symbol_for — PubliSci::Registry
- #title — PubliSci::Metadata::DSL
- #to_h — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #to_h — RDF::Query::Solutions
- #to_literal — PubliSci::RDFParser
- #to_n3 — PubliSci::DataSet::ORM::DataCube
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Activity
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Agent
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Association
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Derivation
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Entity
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Plan
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Role
- #to_n3 — PubliSci::Prov::Usage
- #to_repository — PubliSci::DSL
- #to_repository — PubliSci::Prov::DSL
- #to_resource — PubliSci::RDFParser
- #to_s — PubliSci::Prov::Activity
- #to_s — PubliSci::Prov::Agent
- #to_s — PubliSci::Prov::Association
- #to_s — PubliSci::Prov::Derivation
- #to_s — PubliSci::Prov::Entity
- #to_s — PubliSci::Prov::Plan
- #to_s — PubliSci::Prov::Role
- #to_s — PubliSci::Prov::Usage
- #topic — PubliSci::Metadata::DSL
- #try_auto_set — PubliSci::Prov::DSL
- #try_auto_set — PubliSci::Prov::Element
- #turtle_indent — PubliSci::RDFParser
- #turtle_to_ruby — PubliSci::Writers::Base
- #type — PubliSci::Prov::Agent
- #type= — PubliSci::Prov::Agent
- #unindent — String
- #uri — PubliSci::Metadata::Publisher
- #url — PubliSci::Metadata::Publisher
- #url — PubliSci::Store
- #used — PubliSci::Prov::Activity
- #valid? — PubliSci::Parsers::Base
- #var — PubliSci::Metadata::DSL
- #vocabulary — PubliSci::Dataset::DataCube
- #vocabulary — PubliSci::Vocabulary
- #vocabulary — PubliSci::Query
- #wasAssociatedWith — PubliSci::Prov::Activity
- #worked_for — PubliSci::Prov::Agent
- #write — PubliSci::Generators::Base
- #write_to — PubliSci::Generators::Base