Here is a list of all documented functions with links to the documentation:
- v -
- Vacc_allocate() : vacc.c
- Vacc_atomdSASA() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_atomdSAV() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_atomSASA() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_atomSASPoints() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_atomSurf() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_ctor() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_ctor2() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_dtor() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_dtor2() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_fastMolAcc() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_ivdwAcc() : vacc.h
- Vacc_memChk() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_molAcc() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_SASA() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAcc() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccAtom() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccGrad() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccGradAtomNorm() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccGradAtomNorm3() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccGradAtomNorm4() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_splineAccGradAtomUnnorm() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_storeParms() : vacc.c
- Vacc_totalAtomdSASA() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_totalAtomdSAV() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_totalSASA() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_totalSAV() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_vdwAcc() : vacc.h
- Vacc_wcaEnergy() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_wcaEnergyAtom() : vacc.c, vacc.h
- Vacc_wcaForceAtom() : vacc.c, vacc.h
- VaccSurf_ctor() : vacc.c, vacc.h
- VaccSurf_ctor2() : vacc.c, vacc.h
- VaccSurf_dtor() : vacc.c, vacc.h
- VaccSurf_dtor2() : vacc.c, vacc.h
- VaccSurf_refSphere() : vacc.c, vacc.h
- Valist_ctor() : valist.c, valist.h
- Valist_ctor2() : valist.c, valist.h
- Valist_dtor() : valist.c, valist.h
- Valist_dtor2() : valist.c, valist.h
- Valist_getAtom() : valist.c, valist.h
- Valist_getAtomList() : valist.c, valist.h
- Valist_getCenterX() : valist.c, valist.h
- Valist_getCenterY() : valist.c, valist.h
- Valist_getCenterZ() : valist.c, valist.h
- Valist_getNumberAtoms() : valist.c, valist.h
- Valist_getStatistics() : valist.c, valist.h
- Valist_memChk() : valist.c, valist.h
- Valist_readPDB() : valist.c, valist.h
- Valist_readPQR() : valist.c, valist.h
- Valist_readXML() : valist.c, valist.h
- Vatom_copyFrom() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_copyTo() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_ctor() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_ctor2() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_dtor() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_dtor2() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getAtomID() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getAtomName() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getCharge() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getEpsilon() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getPartID() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getPosition() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getRadius() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_getResName() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_memChk() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setAtomID() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setAtomName() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setCharge() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setEpsilon() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setPartID() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setPosition() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setRadius() : vatom.c, vatom.h
- Vatom_setResName() : vatom.c, vatom.h
- Vcap_cosh() : vcap.c, vcap.h
- Vcap_exp() : vcap.c, vcap.h
- Vcap_sinh() : vcap.c, vcap.h
- Vclist_ctor() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_ctor2() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_dtor() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_dtor2() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_getCell() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_maxRadius() : vclist.c, vclist.h
- Vclist_memChk() : vclist.c, vclist.h
- VclistCell_ctor() : vclist.c, vclist.h
- VclistCell_ctor2() : vclist.c, vclist.h
- VclistCell_dtor() : vclist.c, vclist.h
- VclistCell_dtor2() : vclist.c, vclist.h
- Vcsm_ctor() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_ctor2() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_dtor() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_dtor2() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getAtom() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getAtomIndex() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getNumberAtoms() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getNumberSimplices() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getSimplex() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getSimplexIndex() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_getValist() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_init() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_memChk() : vcsm.c, vcsm.h
- Vcsm_update() : vcsm.c, vcsm.h
- VFCHI4() : vpmg.c, vpmg.h
- Vfetk_ctor() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_ctor2() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_dqmEnergy() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_dtor() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_dtor2() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_dumpLocalVar() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_energy() : vfetk.c
- Vfetk_externalUpdateFunction() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_fillArray() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_genCube() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getAM() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getAtomColor() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getGem() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getSolution() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getVcsm() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_getVpbe() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_loadGem() : vfetk.h
- Vfetk_loadMesh() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_memChk() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_bisectEdge() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_ctor() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_ctor2() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_delta() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_DFu_wv() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_dtor() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_dtor2() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_Fu() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_Fu_v() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_initAssemble() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_initElement() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_initFace() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_initPoint() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_Ju() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_mapBoundary() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_markSimplex() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_oneChart() : vfetk.h
- Vfetk_PDE_simplexBasisForm() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_simplexBasisInit() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_u_D() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_PDE_u_T() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_qfEnergy() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_readMesh() : vfetk.h
- Vfetk_setAtomColors() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_setParameters() : vfetk.c, vfetk.h
- Vfetk_write() : vfetk.c, vfetk.h
- Vgreen_coulomb() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_coulomb_direct() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_coulombD() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_coulombD_direct() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_ctor() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_ctor2() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_dtor() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_dtor2() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_getValist() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_helmholtz() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_helmholtzD() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgreen_memChk() : vgreen.c, vgreen.h
- Vgrid_ctor() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_ctor2() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_curvature() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_dtor() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_dtor2() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_gradient() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_integrate() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_memChk() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_normH1() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_normL1() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_normL2() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_normLinf() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_readDX() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_readDXBIN() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_readGZ() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_seminormH1() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_value() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_writeDX() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_writeDXBIN() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_writeGZ() : vgrid.c, vgrid.h
- Vgrid_writeUHBD() : vgrid.c, vgrid.h
- Vmgrid_addGrid() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_ctor() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_ctor2() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_curvature() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_dtor() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_dtor2() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_getGridByNum() : vmgrid.h
- Vmgrid_getGridByPoint() : vmgrid.h
- Vmgrid_gradient() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vmgrid_value() : vmgrid.c, vmgrid.h
- Vopot_ctor() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_ctor2() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_curvature() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_dtor() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_dtor2() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_gradient() : vopot.c, vopot.h
- Vopot_pot() : vopot.c, vopot.h
- Vparam_AtomData_copyFrom() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_AtomData_copyTo() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_AtomData_ctor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_AtomData_ctor2() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_AtomData_dtor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_AtomData_dtor2() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ctor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ctor2() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_dtor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_dtor2() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_getAtomData() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_getResData() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_memChk() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_readFlatFile() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_readXMLFile() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ResData_copyTo() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ResData_ctor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ResData_ctor2() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ResData_dtor() : vparam.c, vparam.h
- Vparam_ResData_dtor2() : vparam.c, vparam.h
- Vpbe_ctor() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_ctor2() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_dtor() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_dtor2() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getBulkIonicStrength() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getCoulombEnergy1() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getDeblen() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getGamma() : vpbe.h
- Vpbe_getIons() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getLmem() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getMaxIonRadius() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getmembraneDiel() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getmemv() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteCenter() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteCharge() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteDiel() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteRadius() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteXlen() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteYlen() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSoluteZlen() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSolventDiel() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getSolventRadius() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getTemperature() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getVacc() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getValist() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getXkappa() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getZkappa2() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getZmagic() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_getzmem() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpbe_memChk() : vpbe.c, vpbe.h
- Vpee_ctor() : vpee.c, vpee.h
- Vpee_ctor2() : vpee.c, vpee.h
- Vpee_dtor() : vpee.c, vpee.h
- Vpee_dtor2() : vpee.c, vpee.h
- Vpee_markRefine() : vpee.c, vpee.h
- Vpee_numSS() : vpee.c, vpee.h
- Vpmg_ctor() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_ctor2() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_dbDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_dbForce() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_dbMutualPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_dbNLDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_dbPermanentMultipoleForce() : vpmg.h
- Vpmg_dielEnergy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_dielGradNorm() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_dtor() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_dtor2() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_energy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_fieldSpline4() : vpmg.h
- Vpmg_fillArray() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_fillco() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_force() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_ibDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_ibForce() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_ibMutualPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_ibNLDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_ibPermanentMultipoleForce() : vpmg.h
- Vpmg_memChk() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_polarizEnergy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_printColComp() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfAtomEnergy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_qfEnergy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfEnergyPoint() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfEnergyVolume() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfForce() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qfMutualPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_qfNLDirectPolForce() : vpmg.h
- Vpmg_qfPermanentMultipoleEnergy() : vpmg.h
- Vpmg_qfPermanentMultipoleForce() : vpmg.h
- Vpmg_qmEnergy() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_qmEnergySMPBE() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_setPart() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_solve() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_solveLaplace() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_splineSelect() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmg_unsetPart() : vpmg.c, vpmg.h
- Vpmgp_ctor() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vpmgp_ctor2() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vpmgp_dtor() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vpmgp_dtor2() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vpmgp_makeCoarse() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vpmgp_size() : vpmgp.c, vpmgp.h
- Vstring_isdigit() : vstring.c, vstring.h
- Vstring_strcasecmp() : vstring.c, vstring.h
- Vstring_wrappedtext() : vstring.c